MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2151103091 · doi:10.1109/tmi.2011.2111422

Perception-Based Visualization of Manifold-Valued Medical Images Using Distance-Preserving Dimensionality Reduction

2011· article· en· W2151103091 sur OpenAlexafffund
Ghassan Hamarneh, Chris McIntosh, Mark S. Drew

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on Medical Imaging · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesSimon Fraser UniversityJohns Hopkins University
Mots-clésArtificial intelligencePixelIsomapMathematicsNonlinear dimensionality reductionComputer visionPattern recognition (psychology)Manifold (fluid mechanics)Euclidean distanceSimilarity (geometry)Dimensionality reductionComputer scienceImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A method for visualizing manifold-valued medical image data is proposed. The method operates on images in which each pixel is assumed to be sampled from an underlying manifold. For example, each pixel may contain a high dimensional vector, such as the time activity curve (TAC) in a dynamic positron emission tomography (dPET) or a dynamic single photon emission computed tomography (dSPECT) image, or the positive semi-definite tensor in a diffusion tensor magnetic resonance image (DTMRI). A nonlinear mapping reduces the dimensionality of the pixel data to achieve two goals: distance preservation and embedding into a perceptual color space. We use multidimensional scaling distance-preserving mapping to render similar pixels (e.g., DT or TAC pixels) with perceptually similar colors. The 3D CIELAB perceptual color space is adopted as the range of the distance preserving mapping, with a final similarity transform mapping colors to a maximum gamut size. Similarity between pixels is either determined analytically as geodesics on the manifold of pixels or is approximated using manifold learning techniques. In particular, dissimilarity between DTMRI pixels is evaluated via a Log-Euclidean Riemannian metric respecting the manifold of the rank 3, second-order positive semi-definite DTs, whereas the dissimilarity between TACs is approximated via ISOMAP. We demonstrate our approach via artificial high-dimensional, manifold-valued data, as well as case studies of normal and pathological clinical brain and heart DTMRI, dPET, and dSPECT images. Our results demonstrate the effectiveness of our approach in capturing, in a perceptually meaningful way, important features in the data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueIEEE Transactions on Medical ImagingMême sujetAdvanced Neuroimaging Techniques and ApplicationsTravaux en français237 207