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Enregistrement W2151225641 · doi:10.1094/mpmi-11-09-0271

Morphological and Molecular Analyses of Host and Nonhost Interactions Involving Barley and Wheat and the Covered Smut Pathogen <i>Ustilago hordei</i>

2010· article· en· W2151225641 sur OpenAlexaff
D. A. Gaudet, Yuanyuan Wang, Carolyn Penniket, Zhen‐Xiang Lu, Guus Bakkeren, André Laroche

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant-Microbe Interactions · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalloseBiologyUstilagoJasmonic acidMethyl jasmonateGene expressionGeneMicrobiologyDownregulation and upregulationSalicylic acidPlant defense against herbivoryPlant disease resistanceBotanyMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ustilago hordei interactions on coleoptiles of barley host cultivars Odessa (compatible), Hannchen (incompatible, carrying the Ruh1 resistance gene), and on nonhost Neepawa wheat were studied using light and fluorescent microscopy. Autofluorescence, mainly caused by callose accumulation, was more rapidly expressed in nonhost wheat at 30 to 72 h compared with the incompatible reaction between 72 and 144 h. Microarray results demonstrated that more than half of the 893 differentially regulated genes were observed in Neepawa; of these genes, 45% fell into the defense- and stress-related classes in Neepawa compared with 25 and 37% in Odessa and Hannchen, respectively. Their expression coincided with the early morphological defense responses observed and were associated with the jasmonic acid and ethylene (JA/ET) signaling pathway. Expression patterns in Odessa and Hannchen were similar, involving fewer genes and coinciding with later morphological defense responses of these varieties. Although no visible hypersensitive response was apparent in Hannchen or Neepawa, specific upregulation of hypersensitivity-related proteins was observed, such as beta-VPE at 48 h. Expression levels of the callose synthase gene were closely associated with callose accumulation. Differential responses in defense-gene expression among disease reaction types included upregulation of PR-1.1b and downregulation of a nonspecific lipid transfer protein in the incompatible and compatible interactions, respectively. Transcript levels of EDS1 and PAD4, involved in both basal resistance and R-mediated resistance to avirulent pathogens, were up-regulated during both nonhost and Ruh1-mediated resistance. Application of methyl-jasmonate, salicylic acid and ET to leaves revealed that only PR1.1b is strongly up-regulated by all three compounds, while the majority of the defense-related genes are only slightly up-regulated by these signaling compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,609

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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