MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2151446023 · doi:10.1074/mcp.m112.025775

Quantitative Proteomics Reveals the Induction of Mitophagy in Tumor Necrosis Factor-α-activated (TNFα) Macrophages

2013· article· en· W2151446023 sur OpenAlexaff
Christina Bell, Luc English, Jonathan Boulais, Magali Chemali, Olivier Caron-Lizotte, Michel Desjardins, Pierre Thibault

Notice bibliographique

RevueMolecular & Cellular Proteomics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitophagyTumor necrosis factor alphaCell biologyAntigen presentationBiologyAcquired immune systemAntigen processingImmune systemInnate immune systemAntigenCytokineMitochondrionMHC class IProteomicsImmunologyMajor histocompatibility complexT cellAutophagyBiochemistryApoptosisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macrophages play an important role in innate and adaptive immunity as professional phagocytes capable of internalizing and degrading pathogens to derive antigens for presentation to T cells. They also produce pro-inflammatory cytokines such as tumor necrosis factor alpha (TNF-α) that mediate local and systemic responses and direct the development of adaptive immunity. The present work describes the use of label-free quantitative proteomics to profile the dynamic changes of proteins from resting and TNF-α-activated mouse macrophages. These analyses revealed that TNF-α activation of macrophages led to the down-regulation of mitochondrial proteins and the differential regulation of several proteins involved in vesicle trafficking and immune response. Importantly, we found that the down-regulation of mitochondria proteins occurred through mitophagy and was specific to TNF-α, as other cytokines such as IL-1β and IFN-γ had no effect on mitochondria degradation. Furthermore, using a novel antigen presentation system, we observed that the induction of mitophagy by TNF-α enabled the processing and presentation of mitochondrial antigens at the cell surface by MHC class I molecules. These findings highlight an unsuspected role of TNF-α in mitophagy and expanded our understanding of the mechanisms responsible for MHC presentation of self-antigens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular & Cellular ProteomicsMême sujetAutophagy in Disease and TherapyTravaux en français237 207