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Enregistrement W2151518917 · doi:10.1152/ajplung.90331.2008

Adenovirus E1A regulates lung epithelial ICAM-1 expression by interacting with transcriptional regulators at its promoter

2008· article· en· W2151518917 sur OpenAlexafffund
Kiyoshi Morimoto, John V. Gosselink, Aileen Kartono, James C. Hogg, Shizu Hayashi, Emiko Ogawa

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Lung Cellular and Molecular Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensSt. Paul's Hospital
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaDaiichi-SankyoDaiichi Sankyo EuropeBritish Columbia Lung Association
Mots-clésCell biologyPromoterBiologyTranscriptional regulationCancer researchGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We focused on the regulation of inflammatory mediator expression by adenovirus E1A in lung epithelial cells and the role of this viral protein in the pathogenesis of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). We previously reported that E1A, a well-known regulator of host genes, increased ICAM-1 expression in human bronchial epithelial (HBE) and A549 cells in response to LPS stimulation. In this report, we clarified the mechanism of this regulation. We found NF-kappaB translocation to the nucleus after LPS stimulation in both E1A-positive and -negative HBE cells. ICAM-1 promoter reporter constructs revealed that a mutation in the proximal NF-kappaB binding site completely inhibited increased transcription, whereas the mutation in a distal site did not. We analyzed the participation of E1A in transcriptional complex formation at this promoter using chromatin immunoprecipitation. In E1A-positive HBE and A549 cells, LPS stimulation increased ICAM-1 promoter immunoprecipitation by NF-kappaB p65 and p300 but not activator protein-1 antibodies with a concomitant increase by the E1A antibody. No increase was found in E1A-negative cells except in HBE cells with p65 antibody. The association of E1A with the increased promoter immunoprecipitation with p300 was also observed after TNF-alpha stimulation of A549 cells. These results suggest that adenovirus E1A regulates the ICAM-1 promoter through its proximal NF-kappaB binding site, most likely by interacting with the transcriptional complex that forms at this site. E1A regulation of the LPS response may play a role in acute exacerbations as a consequence of bacterial infections in COPD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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