SSX Cancer Testis Antigens are Expressed in Most Multiple Myeloma Patients
Notice bibliographique
Résumé
Cancer testis antigens (CTAs) are tumor-specific antigens that may be useful targets for cancer vaccines. Here, CTA expression was examined in multiple myeloma (MM), a B-cell cancer characterized by malignant plasma cells (PCs) in the bone marrow (BM), and monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS), a condition that can progress to MM. We screened a panel of patient BMs at different stages of malignancy for CTA expression by reverse transcription polymerase chain reaction RT-PCR. Here, SSX (synovial sarcoma, X chromosome) emerged as a promising candidate for an MM vaccine, having a profile similar to currently studied CTA, NY-ESO-1, and MAGE. SSX1, 2, 4, and 5 expression was studied further in 114 MM (total SSX, 61% of patients; SSX1, 42%; SSX2, 23%; SSX4, 38%; SSX5, 35%), 45 MGUS (total SSX, 24% of patients; SSX1, 9%; SSX4, 20%), and 12 control (0/12, 0%) subjects. Several expression patterns were observed, the most predominant being co-expression of SSX1, 2, 4, and 5 (called group A expression, in 20% of MM), which correlated with reduced survival (P=0.0006). Of the four genes, SSX2 had the strongest association with reduced survival (P=0.0001). SSX protein expression ranged from 13.5% of PCs in an SSX1/SSX4 co-expressor to as high as 88% of PCs in group A expressor, exceeding reported frequencies of NY-ESO-1 and MAGE in MM. In single PCs from group A patients, we detected variable degrees of SSX co-expression, emphasizing the heterogeneity of CTA expression within tumor cell populations. These results demonstrate that SSX is a frequently expressed CTA in MM and highlight its potential as an MM vaccine candidate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».