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Enregistrement W2151636105 · doi:10.1073/pnas.0505446102

Ancestral antibiotic resistance in <i>Mycobacterium tuberculosis</i>

2005· article· en· W2151636105 sur OpenAlexaff
Rowan P. Morris, Liem Nguyen, John Gatfield, Kevin Visconti, Kien T. Nguyen, Dirk Schnappinger, Sabine Ehrt, Yang Liu, Leonid Heifets, Jean Pieters, Gary K. Schoolnik, Charles J. Thompson

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesWorld Health OrganizationNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésMicrobiologyMycobacterium tuberculosisBiologyAntibioticsEffluxAntibiotic resistanceMycobacteriumStreptomycesTuberculosisRegulonGeneBacteriaGeneticsMutantMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chemotherapeutic options to treat tuberculosis are severely restricted by the intrinsic resistance of Mycobacterium tuberculosis to the majority of clinically applied antibiotics. Such resistance is partially provided by the low permeability of their unique cell envelope. Here we describe a complementary system that coordinates resistance to drugs that have penetrated the envelope, allowing mycobacteria to tolerate diverse classes of antibiotics that inhibit cytoplasmic targets. This system depends on whiB7, a gene that pathogenic Mycobacterium shares with Streptomyces, a phylogenetically related genus known as the source of diverse antibiotics. In M. tuberculosis, whiB7 is induced by subinhibitory concentrations of antibiotics (erythromycin, tetracycline, and streptomycin) and whiB7 null mutants (Streptomyces and Mycobacterium) are hypersusceptible to antibiotics in vitro. M. tuberculosis is also antibiotic sensitive within a monocyte model system. In addition to antibiotics, whiB7 is induced by exposure to fatty acids that pathogenic Mycobacterium species may accumulate internally or encounter within eukaryotic hosts during infection. Gene expression profiling analyses demonstrate that whiB7 transcription determines drug resistance by activating expression of a regulon including genes involved in ribosomal protection and antibiotic efflux. Components of the whiB7 system may serve as attractive targets for the identification of inhibitors that render M. tuberculosis or multidrug-resistant derivatives more antibiotic-sensitive.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations329
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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