A pathway‐specific transcriptional regulatory gene for nikkomycin biosynthesis in <i>Streptomyces ansochromogenes</i> that also influences colony development
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
DNA sequence analysis of a 7.5 kb XhoI DNA fragment from the region flanking the nikkomycin biosynthesis gene cluster in Streptomyces ansochromogenes revealed one 3.3 kb open reading frame (ORF), designated sanG. The deduced product of sanG (1061 amino acids), which is similar to PimR of Streptomyces natalensis, contains an OmpR-like DNA binding domain in its N-terminal portion and A- and B-type nucleotide binding motifs in the middle of the protein. Disruption of sanG abolished nikkomycin biosynthesis, reduced sporulation and led to brown pigment accumulation. All aspects of this complex phenotype were complemented by a single copy sanG which was integrated into the chromosome. The introduction of multiple copies of sanG resulted in increased nikkomycin production. S1 mapping results indicated that sanG is transcribed from at least three promoters (P1, P2 and P3), P1 being strongly upregulated when production of nikkomycins starts. Two putative transcription units for nikkomycin biosynthesis, starting from sanN and sanO, are dependent on the expression of sanG, whereas a putative transcription unit starting from sanF was not regulated by sanG. These results suggested that sanG encodes a transcriptional activator important for nikkomycin biosynthesis that, unusually, also has pleiotropic effects on secondary metabolism and development.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle