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Enregistrement W2151706818 · doi:10.1186/s12876-015-0342-y

Altered intestinal functions and increased local inflammation in insulin-resistant obese subjects: a gene-expression profile analysis

2015· article· en· W2151706818 sur OpenAlexafffund
Alain Veilleux, Sylvain Mayeur, Jean‐Christophe Bérubé, Jean‐François Beaulieu, Éric Tremblay, Frédéric‐Simon Hould, Yohan Bossé, Denis Richard, Émile Lévy

Notice bibliographique

RevueBMC Gastroenterology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGDF15 and Related Biomarkers
Établissements canadiensMerck Canada Inc. (Canada)Université de MontréalUniversité LavalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de SherbrookeInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalCanadian Institutes of Health ResearchUniversité LavalCanadian Diabetes Association
Mots-clésInsulin resistanceInternal medicineEndocrinologyInsulinInflammationPostprandialDyslipidemiaDownregulation and upregulationMedicineSmall intestineBiologyIncretinDiabetes mellitusGeneType 2 diabetesBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Metabolic alterations relevant to postprandial dyslipidemia were previously identified in the intestine of obese insulin-resistant subjects. The aim of the study was to identify the genes deregulated by systemic insulin resistance in the intestine of severely obese subjects. METHODS: Transcripts from duodenal samples of insulin-sensitive (HOMA-IR < 3, n = 9) and insulin-resistant (HOMA-IR > 7, n = 9) obese subjects were assayed by microarray (Illumina HumanHT-12). RESULTS: A total of 195 annotated genes were identified as differentially expressed between these two groups (Fold change > 1.2). Of these genes, 36 were found to be directly involved in known intestinal functions, including digestion, extracellular matrix, endocrine system, immunity and cholesterol metabolism. Interestingly, all differentially expressed genes (n = 8) implicated in inflammation and oxidative stress were found to be upregulated in the intestine of insulin-resistant compared to insulin-sensitive subjects. Metabolic pathway analysis revealed that several signaling pathways involved in immunity and inflammation were significantly enriched in differently expressed genes and were predicted to be activated in the intestine of insulin-resistant subjects. Using stringent criteria (Fold change > 1.5; FDR < 0.05), three genes were found to be significantly and differently expressed in the intestine of insulin-resistant compared to insulin-sensitive subjects: the transcripts of the insulinotropic glucose-dependant peptide (GIP) and of the β-microseminoprotein (MSMB) were significantly reduced, but that of the humanin like-1 (MTRNR2L1) was significantly increased. CONCLUSION: These results underline that systemic insulin resistance is associated with remodeling of key intestinal functions. Moreover, these data indicate that small intestine metabolic dysfunction is accompanied with a local amplification of low-grade inflammatory process implicating several pathways. Genes identified in this study are potentially triggered throughout the development of intestinal metabolic abnormalities, which could contribute to dyslipidemia, a component of metabolic syndrome and diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,524

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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