Differential Recognition of Old World and New World Arenavirus Envelope Glycoproteins by Subtilisin Kexin Isozyme 1 (SKI-1)/Site 1 Protease (S1P)
Notice bibliographique
Résumé
The arenaviruses are an important family of emerging viruses that includes several causative agents of severe hemorrhagic fevers in humans that represent serious public health problems. A crucial step of the arenavirus life cycle is maturation of the envelope glycoprotein precursor (GPC) by the cellular subtilisin kexin isozyme 1 (SKI-1)/site 1 protease (S1P). Comparison of the currently known sequences of arenavirus GPCs revealed the presence of a highly conserved aromatic residue at position P7 relative to the SKI-1/S1P cleavage side in Old World and clade C New World arenaviruses but not in New World viruses of clades A and B or cellular substrates of SKI-1/S1P. Using a combination of molecular modeling and structure-function analysis, we found that residue Y285 of SKI-1/S1P, distal from the catalytic triad, is implicated in the molecular recognition of the aromatic "signature residue" at P7 in the GPC of Old World Lassa virus. Using a quantitative biochemical approach, we show that Y285 of SKI-1/S1P is crucial for the efficient processing of peptides derived from Old World and clade C New World arenavirus GPCs but not of those from clade A and B New World arenavirus GPCs. The data suggest that during coevolution with their mammalian hosts, GPCs of Old World and clade C New World viruses expanded the molecular contacts with SKI-1/S1P beyond the classical four-amino-acid recognition sequences and currently occupy an extended binding pocket.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».