Investigation of a Novel DNase of <i>Streptococcus suis</i> Serotype 2
Notice bibliographique
Résumé
A secreted nuclease, SsnA, was identified in the virulent Streptococcus suis isolate SX332 and subsequently in each of the type strains of capsular serotypes 1 through 9. Screening of 258 porcine clinical isolates from surface (nasal mucosa or palatine tonsil) or internal (joint, brain or other internal organ) locations revealed a significant relationship (P < 0.001) between expression of nuclease and isolation from an internal site. A 3,126-bp gene, ssnA, was identified from a phenotypically nuclease-negative pGh9:ISS1 insertion mutant, and analysis of the predicted SsnA sequence revealed a 35-amino-acid (aa) secretion signal sequence, a 22-aa DNA-binding domain, and a typical gram-positive cell wall sorting motif. A requirement of Ca2+ and Mg2+ for SsnA activity was determined, and the substrate specificity was found to be for single- and double-stranded linear DNA. Reverse transcription-PCR experiments revealed that ssnA is expressed throughout all stages of S. suis growth, and Western blots with porcine anti-S. suis immune sera against a recombinant, truncated SsnA derivative (rSsnADelta) confirmed that SsnA is expressed in vivo. Furthermore, anti-rSsnADelta antibodies were sufficient to neutralize SsnA activity. Analyses of subcellular fractions of SX332 and derived mutants, on DNA-containing polyacrylamide gels and by Western blotting, suggest that SsnA is cell wall located.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».