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Enregistrement W2151757385 · doi:10.1128/iai.72.2.774-781.2004

Investigation of a Novel DNase of <i>Streptococcus suis</i> Serotype 2

2004· article· en· W2151757385 sur OpenAlexafffund
Michaël C. Fontaine, José Perez‐Casal, Philip Willson

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitut National de la Recherche AgronomiqueUniversity of Leeds
Mots-clésBiologyStreptococcus suisMolecular biologyNucleaseDNAVirulenceRecombinant DNABlotMutantBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A secreted nuclease, SsnA, was identified in the virulent Streptococcus suis isolate SX332 and subsequently in each of the type strains of capsular serotypes 1 through 9. Screening of 258 porcine clinical isolates from surface (nasal mucosa or palatine tonsil) or internal (joint, brain or other internal organ) locations revealed a significant relationship (P < 0.001) between expression of nuclease and isolation from an internal site. A 3,126-bp gene, ssnA, was identified from a phenotypically nuclease-negative pGh9:ISS1 insertion mutant, and analysis of the predicted SsnA sequence revealed a 35-amino-acid (aa) secretion signal sequence, a 22-aa DNA-binding domain, and a typical gram-positive cell wall sorting motif. A requirement of Ca2+ and Mg2+ for SsnA activity was determined, and the substrate specificity was found to be for single- and double-stranded linear DNA. Reverse transcription-PCR experiments revealed that ssnA is expressed throughout all stages of S. suis growth, and Western blots with porcine anti-S. suis immune sera against a recombinant, truncated SsnA derivative (rSsnADelta) confirmed that SsnA is expressed in vivo. Furthermore, anti-rSsnADelta antibodies were sufficient to neutralize SsnA activity. Analyses of subcellular fractions of SX332 and derived mutants, on DNA-containing polyacrylamide gels and by Western blotting, suggest that SsnA is cell wall located.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,638

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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