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Enregistrement W2151791897 · doi:10.1073/pnas.1421376112

Eukaryogenesis, how special really?

2015· review· en· W2151791897 sur OpenAlexafffund
Austin Booth, W. Ford Doolittle

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésSpeculationEvolutionary theoryEukaryoteRhetorical questionEpistemologyValue (mathematics)UniquenessEvolutionary biologyCognitive scienceComputer scienceBiologyPsychologyPhilosophySocial psychologyGeneticsEconomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eukaryogenesis is widely viewed as an improbable evolutionary transition uniquely affecting the evolution of life on this planet. However, scientific and popular rhetoric extolling this event as a singularity lacks rigorous evidential and statistical support. Here, we question several of the usual claims about the specialness of eukaryogenesis, focusing on both eukaryogenesis as a process and its outcome, the eukaryotic cell. We argue in favor of four ideas. First, the criteria by which we judge eukaryogenesis to have required a genuinely unlikely series of events 2 billion years in the making are being eroded by discoveries that fill in the gaps of the prokaryote:eukaryote "discontinuity." Second, eukaryogenesis confronts evolutionary theory in ways not different from other evolutionary transitions in individuality; parallel systems can be found at several hierarchical levels. Third, identifying which of several complex cellular features confer on eukaryotes a putative richer evolutionary potential remains an area of speculation: various keys to success have been proposed and rejected over the five-decade history of research in this area. Fourth, and perhaps most importantly, it is difficult and may be impossible to eliminate eukaryocentric bias from the measures by which eukaryotes as a whole are judged to have achieved greater success than prokaryotes as a whole. Overall, we question whether premises of existing theories about the uniqueness of eukaryogenesis and the greater evolutionary potential of eukaryotes have been objectively formulated and whether, despite widespread acceptance that eukaryogenesis was "special," any such notion has more than rhetorical value.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0040,037
Communication savante0,0080,013
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0040,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations121
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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