Analysis of 106 kb of contiguous DNA sequence from the D genome of wheat reveals high gene density and a complex arrangement of genes related to disease resistance
Notice bibliographique
Résumé
Vast differences exist in genome sizes of higher plants; however, gene count remains relatively constant among species. Differences observed in DNA content can be attributed to retroelement amplification leading to genome expansion. Cytological and genetic studies have demonstrated that genes are clustered in islands rather than distributed at random in the genome. Analysis of gene islands within highly repetitive genomes of plants like wheat remains largely unstudied. The objective of our work was to sequence and characterize a contiguous DNA sequence from chromosome IDS of Aegilops tauschii. An RFLP probe that maps to the Lr21 region of IDS was used to isolate a single BAC. The BAC was sequenced and is 106 kb in length. The contiguous DNA sequence contains a 46-kb retroelement-free gene island containing seven coding sequences. Within the gene island is a complex arrangement of resistance and defense response genes. Overall gene density in this BAC is 1 gene per 8.9 kb. This report demonstrates that wheat and its relatives do contain regions with gene densities similar to that of Arabidopsis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».