Discordant Regulation of microRNA Between Multiple Experimental Models and Human Pulmonary Hypertension
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The dysregulation of microRNA (miRNA) is known to contribute to the pathobiology of pulmonary arterial hypertension (PAH). However, the relationships between changes in tissue and circulating miRNA levels associated with different animal models and human pulmonary hypertension (PH) have not been defined. METHODS: A set of miRNAs that have been causally implicated in PH, including miR-17, -21, -130b, -145, -204, -424, and -503, were measured by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction in the plasma, lung, and right ventricle of three of the most common rodent models of PH: the rat monocrotaline and SU5416 plus chronic hypoxia (SuHx) models and the mouse chronic hypoxia model. Plasma miRNA levels were also evaluated in a cohort of patients with PAH and healthy subjects. RESULTS: Several miRNA showed PH model-dependent perturbations in plasma and tissue levels; however, none of these were conserved across all three experimental models. Principle component analysis of miR expression changes in plasma revealed distinct clustering between rodent models, and SuHx-triggered PH showed the greatest similarity to human PAH. Changes in the plasma levels of several miRNA also correlated with changes in tissue expression. In particular, miR-424 was concordantly increased (1.3- to 1.5-fold, P < .05) in the plasma, lung, and right ventricle of hypoxic mice and in the plasma of patients with PAH. CONCLUSIONS: miRNAs with established etiologic roles in PH showed context-dependent changes in tissue and circulating levels, which were not consistent across rodent models and human PAH. This suggests different miRNA-dependent mechanisms may contribute to experimental and clinical PH, complicating potential diagnostic and therapeutic applications amenable to these miRNAs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».