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Enregistrement W2152043347 · doi:10.1186/1742-4690-2-65

Dual role of TRBP in HIV replication and RNA interference: viral diversion of a cellular pathway or evasion from antiviral immunity?

2005· article· en· W2152043347 sur OpenAlexafffund
Anne Gatignol, Sébastien Lainé, Guerline Clerzius

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Foundation for AIDS Research
Mots-clésEvasion (ethics)Human immunodeficiency virus (HIV)VirologyDual (grammatical number)Viral replicationRNA interferenceReplication (statistics)ImmunitymicroRNAMedicineComputational biologyRNAImmunologyBiologyImmune systemVirusGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Increasing evidence indicates that RNA interference (RNAi) may be used to provide antiviral immunity in mammalian cells. Human micro (mi)RNAs can inhibit the replication of a primate virus, whereas a virally-encoded miRNA from HIV inhibits its own replication. Indirect proof comes from RNAi suppressors encoded by mammalian viruses. Influenza NS1 and Vaccinia E3L proteins can inhibit RNAi in plants, insects and worms. HIV-1 Tat protein and Adenovirus VA RNAs act as RNAi suppressors in mammalian cells. Surprisingly, many RNAi suppressors are also inhibitors of the interferon (IFN)-induced protein kinase R (PKR) but the potential overlap between the RNAi and the IFN pathways remains to be determined. The link between RNAi as an immune response and the IFN pathway may be formed by a cellular protein, TRBP, which has a dual role in HIV replication and RNAi. TRBP has been isolated as an HIV-1 TAR RNA binding protein that increases HIV expression and replication by inhibiting PKR and by increasing translation of structured RNAs. A recent report published in the Journal of Virology shows that the poor replication of HIV in astrocytes is mainly due to a heightened PKR response that can be overcome by supplying TRBP exogenously. In two recent papers published in Nature and EMBO Reports, TRBP is now shown to interact with Dicer and to be required for RNAi mediated by small interfering (si) and micro (mi)RNAs. The apparent discrepancy between TRBP requirement in RNAi and in HIV replication opens the hypotheses that RNAi may be beneficial for HIV-1 replication or that HIV-1 may evade the RNAi restriction by diverting TRBP from Dicer and use it for its own benefit.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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