Genotype-phenotype correlations in recessive RYR1-related myopathies
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: RYR1 mutations are typically associated with core myopathies and are the most common overall cause of congenital myopathy. Dominant mutations are most often associated with central core disease and malignant hyperthermia, and genotype-phenotype patterns have emerged from the study of these mutations that have contributed to the understanding of disease pathogenesis. The recent availability of genetic testing for the entire RYR1 coding sequence has led to a dramatic expansion in the identification of recessive mutations in core myopathies and other congenital myopathies. To date, no clear patterns have been identified in these recessive mutations, though no systematic examination has yet been performed. METHODS: In this study, we investigated genotype-phenotype correlations in a large combined cohort of unpublished (n = 14) and previously reported (n = 92) recessive RYR1 cases. RESULTS: Overall examination of this cohort revealed nearly 50% of cases to be non-core myopathy related. Our most significant finding was that hypomorphic mutations (mutations expected to diminish RyR1 expression) were enriched in patients with severe clinical phenotypes. We also determined that hypomorphic mutations were more likely to be encountered in non-central core myopathies. With analysis of the location of non-hypomorphic mutations, we found that missense mutations were generally enriched in the MH/CCD hotspots and specifically enriched in the selectivity filter of the channel pore. CONCLUSIONS: These results support a hypothesis that loss of protein function is a key predictive disease parameter. In addition, they suggest that decreased RyR1 expression may dictate non-core related pathology though, data on protein expression was limited and should be confirmed in a larger cohort. Lastly, the results implicate abnormal ion conductance through the channel pore in the pathogenesis in recessive core myopathies. Overall, our findings represent a comprehensive analysis of genotype-phenotype associations in recessive RYR1-myopathies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».