High nitrogen fertilization and stem leaning have overlapping effects on wood formation in poplar but invoke largely distinct molecular pathways
Notice bibliographique
Résumé
Previous studies indicated that high nitrogen fertilization may impact secondary xylem development and alter fibre anatomy and composition. The resulting wood shares some resemblance with tension wood, which has much thicker cell walls than normal wood due to the deposition of an additional layer known as the G-layer. This report compares the short-term effects of high nitrogen fertilization and tree leaning to induce tension wood, either alone or in combination, upon wood formation in young trees of Populus trichocarpa (Torr. & Gray) × P. deltoides Bartr. ex Marsh. Fibre anatomy, chemical composition and transcript profiles were examined in newly formed secondary xylem. Each of the treatments resulted in thicker cell walls relative to the controls. High nitrogen and tree leaning had overlapping effects on chemical composition based on Fourier transform infrared analysis, specifically indicating that secondary cell wall composition was shifted in favour of cellulose and hemicelluloses relative to lignin content. In contrast, the high-nitrogen trees had shorter fibres, whilst the leaning trees had longer fibres that the controls. Microarray transcript profiling carried out after 28 days of treatment identified 180 transcripts that accumulated differentially in one or more treatments. Only 10% of differentially expressed transcripts were affected in all treatments relative to the controls. Several of the affected transcripts were related to carbohydrate metabolism, secondary cell wall formation, nitrogen metabolism and osmotic stress. RT-qPCR analyses at 1, 7 and 28 days showed that several transcripts followed very different accumulation profiles in terms of rate and level of accumulation, depending on the treatment. Our findings suggest that high nitrogen fertilization and tension wood induction elicit largely distinct and molecular pathways with partial overlap. When combined, the two types of environmental cue yielded additive effects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».