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Enregistrement W2152127854 · doi:10.1152/ajpgi.00208.2007

IL-6 downregulates transcription of NTPDase2 via specific promoter elements

2008· article· en· W2152127854 sur OpenAlexafffund
Jin Yu, Élise G. Lavoie, Nina Sheung, Jacques Tremblay, Jean Sévigny, Jonathan A. Dranoff

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Gastrointestinal and Liver Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesYale Liver CenterNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchCentre Hospitalier Universitaire de QuébecYale UniversityAmerican Heart Association
Mots-clésDownregulation and upregulationBiologyMolecular biologyCancer researchCell biologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bile ductular proliferation is markedly upregulated in biliary fibrosis and cirrhosis. However, the mechanisms regulating this upregulation in bile ductular proliferation have not been defined. Recently, we demonstrated that expression of the ectonucleotidase nucleoside triphosphate diphosphohydrolase-2 (NTPDase2/Entpd2) by portal fibroblasts (PF) is a critical regulator of bile ductular proliferation. Since interleukin 6 (IL-6) is markedly upregulated in biliary cirrhosis, our aims were to determine the role and mechanism of IL-6 in the regulation of NTPDase2 by PF. We found that IL-6 downregulated NTPDase2 protein expression in a concentration-dependent and time-dependent fashion but did not alter PF alpha-smooth muscle actin expression. IL-6 markedly downregulated NTPDase2 mRNA expression. Expression of the IL-6 receptor gp130 but not the IL-6 receptor gp80 was detected in PF. Two transcription start sites were identified in rat Entpd2 by the method of RNA ligase-mediated rapid amplification of 5' cDNA ends. The minimal promoter construct, but not shorter constructs, was downregulated by IL-6. Three putative IL-6 response elements were identified in silico and mutated. Mutation of all three response elements, but not fewer elements, completely abolished the IL-6 response. Thus IL-6 transcriptionally downregulates NTPDase2 expression by PF via actions at specific promoter elements independently of myofibroblastic differentiation. This effect may represent a novel signaling pathway by which bile ductular proliferation is dysregulated in biliary cirrhosis and thus provides a potential therapeutic approach for the regulation of bile ductular growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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