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Enregistrement W2152192148 · doi:10.1093/carcin/bgp065

Matrix metalloproteinase 1, 3 and 12 polymorphisms and esophageal adenocarcinoma risk and prognosis

2009· article· en· W2152192148 sur OpenAlexaff
Penelope A. Bradbury, Rihong Zhai, Jessica Hopkins, M. Kulke, Rebecca S. Heist, Sheldon M. Singh, Wei Zhou, Clement Ma, Wei Xu, Kofi Asomaning, Monica Ter‐Minassian, Zhonghua Wang, Li Su, David C. Christiani, Geoffrey Liu

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentrePrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésOdds ratioConfidence intervalMMP1Internal medicineMedicineGastroenterologyHaplotypeGeneticsBiologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The matrix metalloproteinase (MMP) family degrade extracellular matrix and mediate pathways including apoptosis, angiogenesis and immunity. We studied the association between four MMP polymorphisms within three MMP genes and esophageal adenocarcinoma (EA) risk and prognosis. A total of 313 EA cases and 455 age and gender frequency-matched controls were genotyped for MMP1 1G/2G, MMP3 6A/5A, MMP12 -82A/G and MMP12 1082A/G. The association between individual MMP polymorphisms and EA risk was evaluated using regression models and adjusted for age, gender, adult body mass index and smoking status. Haplotype analysis was performed to investigate the combined effect of all four linked MMP polymorphisms and EA risk. The MMP1 and MMP3 polymorphisms were associated with increased EA risk: MMP1 1G/2G and 2G/2G had adjusted odds ratios of 1.46 [95% confidence interval 1.0-2.1; P = 0.04] and adjusted odds ratio 1.83 (1.2-2.8; P = 0.005), respectively, whereas MMP3 6A/5A had adjusted odds ratio 1.40 (95% confidence interval 1.0-2.1; P = 0.09) and MMP3 5A/5A had 1.61 (95% confidence interval 1.0-2.5; P = 0.03). Two MMP haplotypes [MMP1-MMP3-MMP12 (-82) 2G-5A-A (adjusted odds ratio 1.36, 95% confidence interval 1.0-1.8; P = 0.03) and 2G-5A-G (adjusted odds ratio 1.70, 95% confidence interval 1.1-2.6; P = 0.01)] were also associated with increased EA risk. The relationship between BE cases with the same set of controls was similar. No association was identified between the MMP polymorphisms and overall survival or progression free survival of patients with EA. MMP1, MMP3 and possibly MMP12 -82A/G polymorphisms and their haplotypes are associated with increased EA risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,940

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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