Molecular Characterization of Cefoxitin-Resistant <i>Escherichia coli</i> from Canadian Hospitals
Notice bibliographique
Résumé
A study designed to gain baseline information on strains of Escherichia coli displaying resistance to cefoxitin in Canada is described. A total of 29,323 E. coli isolates were screened at 12 participating hospital sites as part of an extended-spectrum beta-lactamase surveillance initiative. A total of 411 clinically significant, nonrepeat isolates displaying reduced susceptibilities to the NCCLS-recommended beta-lactams were submitted to a central laboratory over a 1-year period ending on 30 September 2000. Two hundred thirty-two isolates were identified as resistant to cefoxitin. All cefoxitin-resistant strains were subtyped by pulsed-field gel electrophoresis, and of these, 182 strains revealed a unique fingerprint and 1 strain was untypeable. PCR and sequence analysis of the ampC promoter region revealed 51 different promoter or attenuator variants and 14 wild-type promoters. Three promoter regions were interrupted by insertion elements, two contained IS10 elements, and one contained an IS911 variant. PCR and sequence analysis for the detection of acquired AmpC resistance (by the acquisition of ACT-1/MIR-1, CMY-2, or FOX) revealed that 25 strains contained CMY-2, including 7 of the strains found to have wild-type promoters. The considerable genetic variability in both the strain fingerprint and the promoter region suggests that AmpC-type resistance may emerge spontaneously by mutation of sensitive strains rather than by the spread of strains or plasmids in the hospital setting.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».