PS1-22: Tumor--VDW Table Structure Dictated by National Agency Standards
Notice bibliographique
Résumé
Background: North American Association of Central Cancer Registries (NAACCR) was established in 1987 as a collaborative organization for cancer registries, government agencies, professional associations and private groups.NAACCR develops and promotes uniform data standards, provides education and training, certifies population-based registries, processes and publishes data from central registries and promotes the use of cancer surveillance data for research, public health and patient care.Cancer registries in the US include the national central registries, NCI-SEER and CDC-NPCR, individual State registries and hospital-based (care providerbased) registries.The Cancer Research Network (CRN) has adopted NAACCR data standards to define the Virtual Data Warehouse tumor registry table (VDW-TR).However, since the inception of the VDW-TR, there have been many version of NAACCR in effect.Aims/Methods: VDW-TR needed to have similar and merge-able data for multi-site projects.Data standards set by NAACCR are optimal for construction of this resource as they are designed to collect tumor data centrally from multiple data sources.The standards establish processes for data exchange and record layout in addition to coordinating input from sponsoring organizations, such as AJCC and NCI.NAACCR is also responsible for incorporating new items of interest as the data used to characterize cancers evolve.We describe how these changes were incorporated into the VDW-TR.Results: AJCC Collaborative Stage I (CS-1), applicable to cases diagnosed beginning with January 2004, brought many changes to data and data formats required for staging.These changes were not incorporated by the VDW tumor file in 2004 due to the lack of ownership and oversight.Discrepancies eventually developed between VDW data dictionary and NAACCR causing data value decay.ICDO-2 histology lists were expanded and recoded in ICDO-3, providing additional challenges, along with other rules-based changes in tumor classification.CS-1 also mandated addition of anatomic site specific factors.Many additional changes occurred in 2010 with CS-2.The specifications incorporated in our current VDW-TR address all of these data changes.Conclusion: The VDW has to adopt NAACCR changes as they are adapted to remain current with all standards.We are now sensitized to monitor and adjust for significant future changes in NAACCR.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,030 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,008 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,037 | 0,028 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».