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Enregistrement W2152272083 · doi:10.1007/s13173-012-0064-8

Gene clusters as intersections of powers of paths

2012· article· en· W2152272083 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of the Brazilian Computer Society · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenome Rearrangement Algorithms
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Mots-clésCombinatoricsGraphInduced subgraphPath (computing)Intersection (aeronautics)MathematicsGenomeSet (abstract data type)Computer scienceDiscrete mathematicsGeneBiologyGeneticsVertex (graph theory)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract There are various definitions of a gene cluster determined by two genomes and methods for finding these clusters. However, there is little work on characterizing configurations of genes that are eligible to be a cluster according to a given definition. For example, given a set of genes in a genome, is it always possible to find two genomes such that their intersection is exactly this cluster? In one version of this problem, we make use of the graph theory to reformulated it as follows: Given a graph G with n vertices, do there exist two θ -powers of paths G S =( V S , E S ) and G T =( V T , E T ) such that G S ∩ G T contains G as an induced subgraph? In this work, we divide the problem in two cases, depending on whether or not G is an induced subgraph of G S or G T . We show an $\mathcal{O}(n^{2})$ time algorithm that generates the smallest θ -powers of paths G S and G T (with respect to and the number of vertices) that contains G as an induced subgraph. Finally, we discuss the problem when G is an induced subgraph neither of G S nor of G T and we present a method of finding the smallest power of a path when graph G is a cycle C n .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,260

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle