Fragile X protein family member FXR1P is regulated by microRNAs
Notice bibliographique
Résumé
FXR1P is one of two autosomal paralogs of the fragile X mental retardation protein FMRP. The absence of FMRP causes fragile X syndrome, the leading cause of hereditary mental retardation. FXR1P plays an important role in normal muscle development and has been implicated in facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD). Its absence also causes cardiac abnormalities in both mice and zebrafish. To examine miRNA-mediated regulation of FMRP and FXR1P, we studied their expression in a conditional Dicer knockdown cell line, DT40. We found that FXR1P, but not FMRP, is significantly increased upon Dicer knockdown and the consequent reduction of miRNAs, suggesting that FXR1P is regulated by miRNAs while FMRP is not in DT40 cells. Expression of a luciferase reporter bearing the 3' untranslated region (3'UTR) of FXR1 was significantly increased in the absence of miRNAs, confirming miRNA-mediated regulation of FXR1P, while a luciferase reporter bearing the FMR1 3'UTR was not. We identified one of the regulatory regions in the 3'UTR of FXR1 by removing a conserved, 8-nucleotide miRNA seed sequence common to miRNAs 25, 32, 92, 363, and 367 and demonstrated loss of miRNA-mediated suppression. Treatment with specific miRNA hairpin inhibitors to each of the miRNAs in the seed sequence showed that miRs 92b, 363, and 367 regulated FXR1P expression. Accordingly, overexpression of the miRNA 367 mimic significantly decreased endogenous FXR1P expression in human cell lines HEK-293T and HeLa. We report for the first time that FXR1P is regulated through miRNA binding, with one site being the miR-25/32/92/363/367 seed sequence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».