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Enregistrement W2152409371 · doi:10.1002/ajmg.b.30719

A family‐ and population‐based study of the UFD1L gene for schizophrenia

2008· article· en· W2152409371 sur OpenAlexaboutno aff
Lin Xie, Lin Ye, Guizhi Ju, Qi Xu, Xuan Zhang, Shuzheng Liu, Jieping Shi, Yaqin Yu, Zhenqi Wang, Yan Shen, Jun Wei

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part B Neuropsychiatric Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJilin University
Mots-clésHaplotypeGeneticsSingle-nucleotide polymorphismLocus (genetics)BiologyAlleleTransmission disequilibrium testLinkage disequilibriumSNPPopulationGenetic associationGeneGenotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present work was undertaken to investigate the association of the UFD1L locus with schizophrenia among 304 Chinese family trios of Han descent. We detected four single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5'-end region of the UFD1L gene. The transmission disequilibrium test (TDT) revealed allelic associations for rs5746744 (chi(2) = 8.02, P = 0.005) and rs1547931 (chi(2) = 7.18, P = 0.007), but failed to replicate disease association for rs5992403 present in the promoter region, which was initially found in Italian and Canadian samples. The allelic association for rs5746744 and rs1547931 was replicated with independently recruited case-control samples. The 2-SNP haplotype analysis showed an association for the rs5992403-rs5746744 haplotypes (chi(2) = 18.92, df = 3, P = 0.0003), the rs5746744-rs1547931 haplotypes (chi(2) = 11.06, df = 3, P = 0.011) and the rs1547931-rs2238769 haplotypes (chi(2) = 18.88, df = 3, P = 0.0003). The 4-SNP haplotype analysis also showed strong association with illness (chi(2) = 29.54, df = 9, P = 0.0005) but there were more than one individual haplotypes with a low frequency excessively non-transmitted. The four SNPs tested were not located in the same LD block among the Chinese population. This study raises the possibility that a disease-resistant variant may be carried by two or more haplotypes at the UFD1L locus due to frequent recombination during meiosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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