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Enregistrement W2152436931

In vivo study of the role of the cytoskeleton and fungal golgi in hyphal tip growth of Aspergillus nidulans

2007· article· en· W2152436931 sur OpenAlexfundno aff
Michelle Anne Hubbard

Notice bibliographique

RevueUniversity Library - University of Saskatchewan (University of Saskatchewan) · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOhio State University
Mots-clésAspergillus nidulansGolgi apparatusHyphaFungal growthCell biologyIn vivoChemistryAspergillusMicrobiologyBiologyBiochemistryEndoplasmic reticulumBiotechnologyGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Filamentous fungi, such as Aspergillus nidulans, are composed of tubular, highly polarized, multinucleate cells called hyphae. Polar growth involves secretion specifically at the hyphal tip. Secretion involves intracellular transport and co-ordination of the cytoskeleton and the endomembrane system. Intracellular transport is likely mediated by cytoskeletal elements, which, in fungal cells consist primarily of actin and microtubules (MTs). An A. nidulans strain transformed with green fluorescent protein (GFP) tagged α-tubulin was utilized in the investigation of relationship between cytoplasmic MT arrays and hyphal growth rate. A. nidulans MTs were observed to be long and flexuous and to run roughly parallel to the long axis of hyphae. No correlation between relative MT abundance and hyphal growth rate was observed, although non-growing hyphae had a lower relative MT abundance than growing hyphae. Actin depolymerization decreased hyphal growth rate while MT depolymerization did not. MT stabilization increased hyphal growth rate. Ethanol, the solvent in which the MT and actin inhibitors were dissolved, increased both average overall growth rate and growth rate variability for individual hyphae. Taxol appeared to interact with irradiation to decreased growth rate during imaging. Golgi are involved in secretion and potentially in polar growth. An A. nidulans α-coatomer protein (COP)I homolog (α-COPI), tagged with GFP, was used to investigate the role(s) of fungal Golgi in polar growth. α-COPI-GFP co-localized with the known Golgi marker, α-2,6-sialyltransferase (ST), tagged with red fluorescent protein (RFP), in untreated hyphae. Based on this observation, I propose that α -COPI-GFP can be used as a proxy for fungal Golgi localization. Fungal Golgi were more abundant at hyphal tips than subapically. Fungal Golgi forward (tipward) velocity correlated with hyphal growth rate. Fungal Golgi forward velocity was, on average, approximately ten times greater than average hyphal growth rate. Actin depolymerization reduced fungal Golgi forward velocity while MT depolymerization did not. However, MT stabilization increased fungal Golgi forward velocity. Polymerized MTs do not appear to be essential for hyphal growth but do appear to be involved in hyphal growth rate variability. MTs also appear to play some role in the movement of fungal Golgi. The distribution and movement of fungal Golgi is clearly related to polarity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,168
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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