Bacterial endophyte communities of two wheatgrass varieties following propagation in different growing media
Notice bibliographique
Résumé
Bacterial endophyte communities of two wheatgrass varieties currently being used in the revegetation of military training ranges were studied. Culturable and direct 16S rDNA PCR amplification techniques were used to describe bacterial communities present in Siberian and slender wheatgrass seeds, leaf tissues, and root tissues following propagation in either sand or a peat-based growing mix. Our hypothesis was that the resulting plant endophytic communities would be distinct, showing not only the presence of endophytes originating from the seed but also the characteristics of growth in the two different growing media. Both culture and culture-independent assays showed the likely translocation of Actinobacteria, Firmicutes, and Gammaproteobacteria from seed to mature plant tissues as well as subsequent colonization by exogenous organisms. Statistical analysis of 16S terminal restriction fragment profiles identified growing media as having a greater significant effect on the formation of the endpoint endophytic communities than either plant tissue or wheatgrass variety. In silico digests of the ribosomal database produced putative identifications indicating an increase in overall species diversity and increased relative abundances of Firmicutes and Cyanobacteria following propagation in sand and Betaproteobacteria following propagation in the peat-based growing mix. Results indicated a substantial translocation of endophytes from seed to mature plant tissues for both growing media and that growing medium was a dominant determinant of the final taxonomy of the endpoint plant endophytic communities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».