Chemical Inhibitors Suggest Endophytic Fungal Paclitaxel Is Derived from Both Mevalonate and Non-mevalonate-like Pathways
Notice bibliographique
Résumé
Taxus trees possess fungal endophytes reported to produce paclitaxel. Inhibitors that block early steps in plant paclitaxel biosynthesis were applied to a paclitaxel-producing fungus to determine whether these steps are shared. The plant paclitaxel backbone is reportedly derived from the non-mevalonate terpenoid pathway, while the side chain is phenylalanine-derived. Evidence that the shikimate pathway contributes to fungal paclitaxel was shown by decreased paclitaxel accumulation following inhibition of phenylalanine ammonia lyase. Expression of another shikimate pathway enzyme, 3-dehydroquinate synthase, coincided with paclitaxel production. The importance of the mevalonate pathway in fungal paclitaxel biosynthesis was shown by inhibition of fungal paclitaxel accumulation using compactin, a specific inhibitor of 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA reductase. Expression of another mevalonate pathway enzyme, 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA synthase, coincided with fungal paclitaxel accumulation. Unexpectedly, results from using fosmidomycin suggested that fungal paclitaxel requires 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase (DXR), an enzyme in the 2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate (MEP) pathway normally found in bacteria/plants. Additional lines of evidence support this finding; first, a plant DXR antibody recognized a fungal peptide of the correct size; second, expression of an apparent fungal DXR ortholog correlated to changes in paclitaxel production; finally, BLAST searching identified a gene putatively encoding 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase, the first enzyme in the MEP pathway in Aspergillus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».