Chemical Inhibitors Suggest Endophytic Fungal Paclitaxel Is Derived from Both Mevalonate and Non-mevalonate-like Pathways
Notice bibliographique
Résumé
Taxus trees possess fungal endophytes reported to produce paclitaxel. Inhibitors that block early steps in plant paclitaxel biosynthesis were applied to a paclitaxel-producing fungus to determine whether these steps are shared. The plant paclitaxel backbone is reportedly derived from the non-mevalonate terpenoid pathway, while the side chain is phenylalanine-derived. Evidence that the shikimate pathway contributes to fungal paclitaxel was shown by decreased paclitaxel accumulation following inhibition of phenylalanine ammonia lyase. Expression of another shikimate pathway enzyme, 3-dehydroquinate synthase, coincided with paclitaxel production. The importance of the mevalonate pathway in fungal paclitaxel biosynthesis was shown by inhibition of fungal paclitaxel accumulation using compactin, a specific inhibitor of 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA reductase. Expression of another mevalonate pathway enzyme, 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA synthase, coincided with fungal paclitaxel accumulation. Unexpectedly, results from using fosmidomycin suggested that fungal paclitaxel requires 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase (DXR), an enzyme in the 2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate (MEP) pathway normally found in bacteria/plants. Additional lines of evidence support this finding; first, a plant DXR antibody recognized a fungal peptide of the correct size; second, expression of an apparent fungal DXR ortholog correlated to changes in paclitaxel production; finally, BLAST searching identified a gene putatively encoding 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase, the first enzyme in the MEP pathway in Aspergillus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».