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Enregistrement W2152687577 · doi:10.1371/journal.pone.0137392

Proportional-Integral-Derivative (PID) Control of Secreted Factors for Blood Stem Cell Culture

2015· article· en· W2152687577 sur OpenAlexafffund
Julia Caldwell, Weijia Wang, Peter W. Zandstra

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHematopoietic Stem Cell Transplantation
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversité de MontréalStem Cell NetworkUniversity of TorontoLeukemia and Lymphoma Society
Mots-clésHaematopoiesisPID controllerProgenitor cellStem cellCell cultureCell biologyChemistryBiologyEngineeringControl engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinical use of umbilical cord blood has typically been limited by the need to expand hematopoietic stem and progenitor cells (HSPC) ex vivo. This expansion is challenging due to the accumulation of secreted signaling factors in the culture that have a negative regulatory effect on HSPC output. Strategies for global regulation of these factors through dilution have been developed, but do not accommodate the dynamic nature or inherent variability of hematopoietic cell culture. We have developed a mathematical model to simulate the impact of feedback control on in vitro hematopoiesis, and used it to design a proportional-integral-derivative (PID) control algorithm. This algorithm was implemented with a fed-batch bioreactor to regulate the concentrations of secreted factors. Controlling the concentration of a key target factor, TGF-β1, through dilution limited the negative effect it had on HSPCs, and allowed global control of other similarly-produced inhibitory endogenous factors. The PID control algorithm effectively maintained the target soluble factor at the target concentration. We show that feedback controlled dilution is predicted to be a more cost effective dilution strategy compared to other open-loop strategies, and can enhance HSPC expansion in short term culture. This study demonstrates the utility of secreted factor process control strategies to optimize stem cell culture systems, and motivates the development of multi-analyte protein sensors to automate the manufacturing of cell therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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