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Enregistrement W2152699800 · doi:10.4161/auto.6.3.11305

Nod proteins link bacterial sensing and autophagy

2010· article· en· W2152699800 sur OpenAlexaff
Leonardo H. Travassos, Letícia A. M. Carneiro, Stephen E. Girardin, Dana J. Philpott

Notice bibliographique

RevueAutophagy · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyATG16L1BiologyIntracellular parasiteIntracellularPeptidoglycanCell biologyNOD2NOD1InflammasomeBAG3Innate immune systemMicrobiologyBacteriaReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autophagy is one of the main cellular degradation systems in eukaryotes, responsible for the elimination of long-lived proteins and damaged organelles. Besides its well-documented role as a housekeeping mechanism, autophagy has recently caught the attention of groups working in the fields of microbiology and immunology, especially those working in innate immunity. In particular, the highly specific segregation and degradation of intracellular bacteria by the autophagic machinery was a matter of great interest. However, it was still unclear how the autophagy machinery could target intracellular bacteria with such specificity. We have recently analyzed the role of the intracellular peptidoglycan (PG) receptors Nod1 and Nod2 as a link between intracellular bacterial sensing and the induction of autophagy. Our results demonstrated that Nod2 recruits the critical autophagy protein ATG16L1 to the plasma membrane during bacterial invasion and that cells expressing mutations in these proteins--two of the most important associated with Crohn disease--autophagy is defective upon infection or stimulation with the bacterial peptidoglycan fragment MDP. Thus, our findings put together two genes previously reported as independent risk factors for the development of Crohn disease and open a venue in the study of new therapies to cure the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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