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Enregistrement W2152792768 · doi:10.1098/rstb.2009.0274

On the origin of species: insights from the ecological genomics of lake whitefish

2010· review· en· W2152792768 sur OpenAlexaff
Louis Bernatchez, Sébastien Renaut, Andrew R. Whiteley, Nicolas Derôme, Julie Jeukens, L. LANDRY, Guoqing Lu, Arne W. Nolte, Kjartan Østbye, Sean M. Rogers, Jérôme St‐Cyr

Notice bibliographique

RevuePhilosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences · 2010
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSympatric speciationGenetic algorithmContext (archaeology)GenomicsPopulation genomicsBiologyReproductive isolationEcological speciationGenomic informationEcologyCoregonusDivergence (linguistics)Adaptation (eye)Natural selectionEvolutionary biologyPopulationData scienceSelection (genetic algorithm)Computer scienceGenomeFish <Actinopterygii>FisheryArtificial intelligenceSociologyGenetic variationGene flowGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In contrast to the large amount of ecological information supporting the role of natural selection as a main cause of population divergence and speciation, an understanding of the genomic basis underlying those processes is in its infancy. In this paper, we review the main findings of a long-term research programme that we have been conducting on the ecological genomics of sympatric forms of whitefish (Coregonus spp.) engaged in the process of speciation. We present this system as an example of how applying a combination of approaches under the conceptual framework of the theory of adaptive radiation has yielded substantial insight into evolutionary processes in a non-model species. We also discuss how the joint use of recent biotechnological developments will provide a powerful means to address issues raised by observations made to date. Namely, we present data illustrating the potential offered by combining next generation sequencing technologies with other genomic approaches to reveal the genomic bases of adaptive divergence and reproductive isolation. Given increasing access to these new genomic tools, we argue that non-model species studied in their ecological context such as whitefish will play an increasingly important role in generalizing knowledge of speciation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,937
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations251
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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