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Enregistrement W2152875909 · doi:10.1128/iai.01444-13

Identification of a Crucial Residue Required for Staphylococcus aureus LukAB Cytotoxicity and Receptor Recognition

2013· article· en· W2152875909 sur OpenAlexfundno aff
Ashley Dumont, Pauline Yoong, Xiang Liu, Christopher J. Day, Nicole M. Chumbler, David B. A. James, Francis Alonzo, Nadine J. Bode, D. Borden Lacy, Michael P. Jennings, Victor J. Torres

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSchool of Medicine, New York UniversityNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Health and Medical Research CouncilNYU Langone Medical CenterYork UniversityNational Institute of General Medical SciencesAmerican Heart Association
Mots-clésStaphylococcus aureusBiologyCytotoxicityMicrobiologyResidue (chemistry)ReceptorComputational biologyBacteriaBiochemistryIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The bicomponent leukotoxins produced by Staphylococcus aureus kill host immune cells through osmotic lysis by forming β-barrel pores in the host plasma membrane. The current model for bicomponent pore formation proposes that octameric pores, comprised of two separate secreted polypeptides (S and F subunits), are assembled from water-soluble monomers in the extracellular milieu and multimerize on target cell membranes. However, it has yet to be determined if all staphylococcal bicomponent leukotoxin family members exhibit these properties. In this study, we report that leukocidin A/B (LukAB), the most divergent member of the leukotoxin family, exists as a heterodimer in solution rather than two separate monomeric subunits. Notably, this property was found to be associated with enhanced toxin activity. LukAB also differs from the other bicomponent leukotoxins in that the S subunit (LukA) contains 33- and 10-amino-acid extensions at the N and C termini, respectively. Truncation mutagenesis revealed that deletion of the N terminus resulted in a modest increase in LukAB cytotoxicity, whereas the deletion of the C terminus rendered the toxin inactive. Within the C terminus of LukA, we identified a glutamic acid at position 323 that is critical for LukAB cytotoxicity. Furthermore, we discovered that this residue is conserved and required for the interaction between LukAB and its cellular target CD11b. Altogether, these findings provide an in-depth analysis of how LukAB targets neutrophils and identify novel targets suitable for the rational design of anti-LukAB inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,495
Score d'incertitude au seuil0,514

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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