Phylogeny and effects of anoxia on hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated channel gene expression in the heart of a primitive chordate, the Pacific Hagfish (<i>eptatretus stoutii</i>)
Notice bibliographique
Résumé
The aneural heart of the Pacific hagfish, Eptatretus stoutii, varies heart rate fourfold during recovery from anoxia. Hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated (HCN) channels, which play an important role in establishing the pacemaker rate of vertebrate hearts, were postulated to be present in this ancestral vertebrate heart, and it was also theorized that changes in hagfish heart rate with oxygen availability involved altered HCN expression. Partial gene cloning revealed six HCN isoforms in the hagfish heart. Hagfish representatives of HCN2, HCN3 and HCN4 were discovered, with HCN2 and HCN3 existing as isoforms designated as HCN2a, HCN2b, HCN3a, two paralogs of HCN3b, and HCN3c. Phylogenetic analysis revealed HCN3b and HCN3c to be ancestral, followed by HCN3a, HCN4 and HCN2. Moreover, HCN3a expression was dominant in both the atrial and ventricular chambers, suggesting that the HCN4 dominance in adult mammalian hearts appeared after hagfish divergence. HCN expression was higher in the atrium than in the ventricle, as might be expected given that atrial beating rate is known to be faster than the ventricular rate. In addition, mRNA expression under normoxic conditions was compared with that following 24 h of anoxia, and either a 2-h or 36-h recovery in normoxic water. In the ventricle, anoxia decreased HCN3a but not HCN4 expression. In contrast, atrial HCN3a expression significantly increased following 2 h of recovery, before returning to control levels following 36 h of recovery, possibly contributing to heart rate changes previously observed under these conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».