Expression of the <i>Salmonella</i> Spp. Virulence Factor SifA in Yeast Alters Rho1 Activity on Peroxisomes
Notice bibliographique
Résumé
The Salmonella typhimurium effector protein SifA regulates the assembly and tubulation of the Salmonella phagosome. SifA localizes to the phagosome and interacts with the membrane via its prenylated tail. SifA is a structural homologue of another bacterial effector that acts as a GTP-exchange factor for Rho family GTPases and can bind GDP-RhoA. When coexpressed with a bacterial lipase that is activated by RhoA, SifA can induce tubulation of mammalian endosomes. In an effort to develop a genetic system to study SifA function, we expressed SifA and characterized its activity in yeast. GFP-SifA predominantly localized to yeast peroxisomal membranes. Under peroxisome-inducing conditions, GFP-SifA reduced the number of free peroxisomes and promoted the formation of large peroxisomes with membrane invaginations. GFP-SifA activity depended on the recruitment to peroxisomes of wild-type Rho1p and Pex25p, a receptor for Rho1p. GFP-SifA could also rescue the actin organization defects in pex25Δ and rho1 mutants, suggesting that SifA may recruit and potentiate Rho1p activity. We reexamined the distribution of GFP-SifA in mammalian cells and found the majority colocalizing with LAMP1-positive compartment and not with the peroxisomal marker PMP70. Together, these data suggest that SifA may use a similar mode of action via Rho proteins to alter yeast peroxisomal and mammalian endosomal membranes. Further definition of SifA activity on yeast peroxisomes could provide more insight into its role in regulating host membrane dynamics and small GTPases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».