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Enregistrement W2153067282 · doi:10.1530/rep-13-0114

Differential gene expression of granulosa cells after ovarian superstimulation in beef cattle

2013· article· en· W2153067282 sur OpenAlexafffund
F. C. F. Dias, Muhammad Irfan-ur-Rehman Khan, Marc‐André Sirard, Gregory P. Adams, Jaswant Singh

Notice bibliographique

RevueReproduction · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFollicular phaseEndocrinologyInternal medicineEstrous cycleBiologyLuteinizing hormoneDownregulation and upregulationMicroarray analysis techniquesMicroarrayAndrologyCorpus luteumOvarian follicleGene expressionOvaryGeneHormoneMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microarray analysis was used to compare the gene expression of granulosa cells from dominant follicles with that of those after superstimulatory treatment. Cows were allocated randomly to two groups (superstimulation and control, n=6/group). A new follicular wave was induced by ablation of follicles ≥5 mm in diameter, and a progesterone-releasing device controlled internal drug release (CIDR) was placed in the vagina. The superstimulation group was given eight doses of 25 mg FSH at 12-h intervals starting from the day of wave emergence (day 0), whereas the control group was not given FSH treatment. Both groups were given prostaglandin F2α twice, 12 h apart, on day 3 and the CIDR was removed at the second injection; 25 mg porcine luteinizing hormone (pLH) was given 24 h after CIDR removal, and cows were ovariectomized 24 h later. Granulosa cells were collected for RNA extraction, amplification, and microarray hybridization. A total of 190 genes were downregulated and 280 genes were upregulated. To validate the microarray results, five genes were selected for real-time PCR (NTS, FOS, THBS1, FN1, and IGF2). Expression of four genes increased significantly in the three different animals tested (NTS, FOS, THBS1, and FN1). The upregulated genes are related to matrix remodeling (i.e. tissue proliferation), disturbance of angiogenesis, apoptosis, and oxidative stress response. We conclude that superstimulation treatment i) results in granulosa cells that lag behind in maturation and differentiation (most of the upregulated genes are markers of the follicular growth stage), ii) activates genes involved with the NFE2L2 oxidative stress response and endoplasmic reticulum stress response, and iii) disturbs angiogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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