Coherent patterns in bacterial growth, growth efficiency, and leucine metabolism along a northeastern Pacific inshore‐offshore transect
Notice bibliographique
Résumé
We investigated the patterns in bacterial growth, production, respiration, growth efficiency (BGE), and bacterial leucine respiration and C‐to‐leucine yield (i.e., conversion factor [CF]) along a transect off the coast of Oregon. Plankton respiration along the transect averaged 1.15 ± 0.16 mg C L −1 h −1 , peaking in the coastal upwelling region. The respiration in the filtered fraction, which was dominated by bacterial biomass, accounted for 79% of the total respiration. The different approaches that we used converged to an average BGE of 13% ± 1%, with peaks of over 20% in the more productive coastal areas and values declining to below 5% toward the oligotrophic gyre waters. There was overall coherence between the various aspects of bacterial C metabolism: communities with low BGE also tended to have low growth rates and high leucine‐to‐thymidine incorporation ratios. The patterns in BGE were mirrored at the single compound level, and in the most oligotrophic sites, bacteria tended to quickly respire a large fraction (20–75%) of the leucine that was taken up and had the lowest C‐to‐leucine yield, suggesting that the patterns in bulk BGE and growth also apply to individual substrates. Bacterial growth was a function of both C consumption and BGE; these two aspects of bacterial C metabolism do not necessarily covary, and they are regulated differently. The patterns in C consumption, growth, BGE, and leucine metabolism all reflect the basic physiological response of bacteria to energy limitation due to high maintenance costs associated with life in oligotrophy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».