Use of Microsatellites to Determine Population Structure and Migration of Pacific Herring in British Columbia and Adjacent Regions
Notice bibliographique
Résumé
Abstract This study assessed genetic population structure of Pacific herring Clupea pallasii in British Columbia and adjacent regions by analyzing microsatellite variation; the utility of microsatellites for stock identification applications was also evaluated. Variation at 14 loci was surveyed in approximately 26,000 Pacific herring from 90 sampling locations. Estimates of the genetic differentiation index FST by locus varied between 0.000 and 0.014, and the mean across all loci was 0.003. Four stocks of Pacific herring were defined in British Columbia, and stocks were also identified in southeast Alaska, Washington, and California. In British Columbia, differences in timing of spawning are the main isolating mechanisms among stocks, although geographic isolation of the spawning populations may also have some effect in maintaining the genetic distinctiveness of each stock. The limited genetic differentiation among Pacific herring populations in British Columbia is consistent with among‐population straying rates that are sufficient to homogenize allele frequencies over broad areas. Analysis of simulated mixtures from fishery sampling suggested that acceptable estimates of stock composition were achieved by use of the microsatellites. Mixed‐stock samples (∼1,700 individuals) were collected during research vessel surveys from 14 locations in British Columbia. Analysis of summer mixed‐stock samples from the Strait of Georgia and adjacent waters indicated that resident fish on the west side of the strait were mainly derived from primary‐spawning populations (i.e., those that spawned during the primary period in March) that failed to migrate to traditional summer feeding grounds. On the east side of the strait, Pacific herring of mainland inlet origin were found in higher proportions and presumably did not move in appreciable numbers to feeding areas off the west coast of Vancouver Island. In northern British Columbia, fish from northern late‐spawning populations dominated fishery samples collected in waters adjacent to the mainland until the end of June; however, by late July, this group had been replaced almost entirely by primary‐spawning Pacific herring of British Columbia origin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».