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Enregistrement W2153208546 · doi:10.1101/sqb.2010.75.026

Structure and Function of the Perinucleolar Compartment in Cancer Cells

2010· article· en· W2153208546 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésRibonucleoproteinNucleolusBiologyHeLaCell biologyPolypyrimidine tract-binding proteinRNAMolecular biologyRNA-binding proteinRNA splicingIn vitroChemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The perinucleolar compartment (PNC) is a subnuclear body that forms in cancer cells. In vivo analyses using human tumor tissues demonstrate a close correlation between PNC prevalence and disease progress in colorectal carcinoma, and a high PNC prevalence is associated with poor patient outcome. These findings are consistent with previous observations in breast cancer and cancer cell lines in vitro. The PNC is composed of thick strands that form a filamental meshwork often extending into the nucleolus. Although it appears to be electron dense as observed by transmission electron microscopy (TEM), the actual density of the structure imaged by electron spectroscopy is much lower, similar to that of the interchromatin space, and is lined with ribonucleoproteins (RNPs). In situ detections show that the PNC is highly enriched with a subset of small RNAs of polymerase III (Pol III) origins and RNA-binding proteins primarily implicated in pre-mRNA processing. A novel gel-shifting approach demonstrates that the addition of PNC-associated RNAs into HeLa cell lysates increases the mobility of polypyrimidine tract-binding (PTB) protein in a native gel electrophoresis, suggesting an interaction between these RNAs and PTB proteins. On the basis of these and other findings, we propose a working model in which novel RNPs have a key role in regulating gene expression at the PNC in cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,230
Score d'incertitude au seuil0,282

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle