Mucus composition and bacterial communities associated with the tissue and skeleton of three scleractinian corals maintained under culture conditions
Notice bibliographique
Résumé
Corals live in close association with bacterial communities, but the nature of the relationship is still poorly understood. In this study, three scleractinian coral species, Galaxea fascicularis, Pavona cactus and Turbinaria reniformis were incubated under different laboratory conditions, and the composition of the bacterial community associated with their tissue or skeleton was compared between species or between species and seawater using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). The amount of dissolved organic carbon (DOC) excreted and the mucus glycoconjugate composition were also determined for each species. The aim of the study was to assess if the bacterial community composition was species-specific or linked either to the seawater composition, or to the quality and quantity of carbon released by each coral. Results obtained showed that DOC release was significantly different ( P < 0.0001) for the three species, with the highest excretion rate for G. fascicularis . Also, the mucus of G. fascicularis and P. cactus mainly contained galactose and glucose whereas the mucus of T. reniformis contained more glucose and xylose. Cluster analyses of microbial community composition showed that the bacterial community was species-specific in the coral tissue but not in the skeleton, in all conditions. It remained specific when corals were incubated in the same or in different aquaria, and under different seawater renewal rates. Since DOC release rates and bacterial composition were both different according to the coral species considered, a link might be suggested between the two parameters. Sequencing of DGGE bands indicated that some bacterial phylotypes were consistently retrieved in all samples of a given species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».