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Enregistrement W2153316664 · doi:10.1074/jbc.m113.464792

Mice Lacking α-Tubulin Acetyltransferase 1 Are Viable but Display α-Tubulin Acetylation Deficiency and Dentate Gyrus Distortion

2013· article· en· W2153316664 sur OpenAlexafffund
Go-Woon Kim, Lin Li, Mohammad Gorbani, Linya You, Xiang-Jiao Yang

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAcetylationMicrotubuleBiologyTubulinAcetyltransferaseDoublecortinCell biologyCaenorhabditis elegansDentate gyrusGeneticsNeuroscienceCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Biological functions of mammalian Atat1 and its contribution to ␣-tubulin acetylation in vivo remain elusive.Results: Atat1-null mice are viable but possess deficient ␣-tubulin acetylation and a bulge in the dentate gyrus.Conclusion: Mouse Atat1 is a predominant ␣-tubulin acetyltransferase in vivo and fine-tunes hippocampus development.Significance: Mammalian Atat1 is not required for survival and development but may regulate more advanced functions.␣-Tubulin acetylation at Lys-40, located on the luminal side of microtubules, has been widely studied and used as a marker for stable microtubules in the cilia and other subcellular structures, but the functional consequences remain perplexing. Recent studies have shown that Mec-17 and its paralog are responsible for ␣-tubulin acetylation in Caenorhabditis elegans.There is one such protein known as Atat1 (␣-tubulin acetyltransferase 1) per higher organism.Zebrafish Atat1 appears to govern embryo development, raising the intriguing possibility that Atat1 is also critical for development in mammals.In addition to Atat1, three other mammalian acetyltransferases, ARD1-NAT1, ELP3, and GCN5, have been shown to acetylate ␣-tubulin in vitro, so an important question is how these four enzymes contribute to the acetylation in vivo.We demonstrate here that Atat1 is a major ␣-tubulin acetyltransferase in mice.It is widely expressed in mouse embryos and tissues.Although Atat1-null animals display no overt phenotypes, ␣-tubulin acetylation is lost in sperm flagella and the dentate gyrus is slightly deformed.Furthermore, human ATAT1 colocalizes on bundled microtubules with doublecortin.These results thus suggest that mouse Atat1 may regulate advanced functions such as learning and memory, thereby shedding novel light on the physiological roles of ␣-tubulin acetylation in mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations148
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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