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Enregistrement W2153362541 · doi:10.1128/iai.02167-14

Distinct Regions of NLRP1B Are Required To Respond to Anthrax Lethal Toxin and Metabolic Inhibition

2014· article· en· W2153362541 sur OpenAlexaff
Jana Neiman-Zenevich, Kuo‐Chieh Liao, Jeremy Mogridge

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacillus and Francisella bacterial research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyMutagenesisMutantToxinReceptorCell biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pattern recognition receptors monitor for signs of infection or cellular dysfunction and respond to these events by initiating an immune response. NLRP1B is a receptor that upon activation recruits multiple copies of procaspase-1, which promotes cytokine processing and a proinflammatory form of cell death termed pyroptosis. NLRP1B detects anthrax lethal toxin when the toxin cleaves an amino-terminal fragment from the protein. In addition, NLRP1B is activated when cells are deprived of glucose or treated with metabolic inhibitors, but the mechanism by which the resulting reduction in cytosolic ATP is sensed by NLRP1B is unknown. Here, we addressed whether these two activating signals of NLRP1B converge on a common sensing system. We show that an NLRP1B mutant lacking the amino-terminal region exhibits some spontaneous activity and fails to be further activated by lethal toxin. This mutant was still activated in cells depleted of ATP, however, indicating that the amino-terminal region is not the sole sensing domain of NLRP1B. Mutagenesis of the leucine-rich repeat domain of NLRP1B provided evidence that this domain is involved in autoinhibition of the receptor, but none of the mutants tested was specifically defective at sensing activating signals. Comparison of two alleles of NLRP1B that differed in their response to metabolic inhibitors, but not to lethal toxin, led to the finding that a repeated sequence in the function to find domain (FIIND) that arose from exon duplication facilitated detection of ATP depletion. These results suggest that distinct regions of NLRP1B detect activating signals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,591
Score d'incertitude au seuil0,319

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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