Association Study of Serotonin Transporter Gene (SLC6A4) in Systemic Sclerosis in European Caucasian Populations
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Serotonin is a key contributing factor in pulmonary arterial hypertension (PAH) by inducing pulmonary arterial smooth muscle cell (PA-SMC) proliferation. This relates specifically to the internalization process in PA-SMC of the serotonin transporter (SLC6A4 or 5-HTT). A long (L)/short (S) (44 base pair insertion) functional polymorphism within the promoter of the transporter SLC6A4 gene has been reported to be associated with familial and idiopathic PAH. Our objective was to determine whether polymorphisms of SLC6A4 confer susceptibility to SSc and its vascular phenotype. METHODS: Three Tag single-nucleotide polymorphisms (SNP) (rs2066713, rs1042173, rs6354) chosen using Hapmap and linkage disequilibrium data were genotyped in a total cohort of 667 SSc patients (56 with PAH, 207 with digital ulcerations) and 447 controls. All individuals were of French Caucasian origin. L/S polymorphism genotyping was determined by polymerase chain reaction in a random subgroup of 364 SSc patients (34 with PAH, 138 with digital ulcerations) and 218 controls. RESULTS: Three polymorphisms (L/S, rs2066713, rs1042173) were in Hardy-Weinberg equilibrium in the control population, but rs6354 deviated. Allelic and genotypic frequencies for these 3 polymorphisms were similar in SSc patients and controls. Subphenotype analyses of subsets with PAH and digital ulceration did not detect any difference between SSc patients compared to controls. CONCLUSION: These results from a large cohort of European Caucasian SSc patients do not support the implication of SLC6A4 in the pathogenesis of SSc and its vascular subphenotypes. However, serotonin pathways remain good candidates to contribute to the vasculopathy of SSc.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».