Calcium-sensing receptor mutations and denaturing high performance liquid chromatography
Notice bibliographique
Résumé
The calcium-sensing receptor (CASR), a plasma membrane G-protein-coupled receptor, is expressed in parathyroid gland and kidney, and controls systemic calcium homeostasis. Inactivating CASR mutations are associated with familial hypocalciuric hypercalcemia (FHH) and neonatal severe hyperparathyroidism, and activating mutations cause autosomal dominant hypocalcemia (ADH). CASR mutation identification plays an important role in the clinical management of mineral metabolism disorders. We describe here a high-throughput method using screening with denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC) to initially interrogate 12 amplicons covering translated exons and exon/intron boundaries, followed by sequencing of any amplicon with a modified melting curve relative to wild type, and direct sequencing of a 13th amplicon encoding the COOH-terminal tail to distinguish causative mutations from three common missense single nucleotide polymorphisms. A blinded analysis of 32 positive controls representing mutations throughout the CASR sequence, as well as 22 negative controls, yielded a concordance rate of 100%. We report eight novel and five recurrent FHH mutations, along with six novel and two recurrent ADH mutations. Thus, DHPLC provides a rapid and effective means to screen for CASR mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».