DNA-Level Variation of Sockeye Salmon in Southeast Alaska and the Nass and Skeena Rivers, British Columbia, with Applications to Stock Identification
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The variation at 14 microsatellite loci and 1 major histocompatibility complex locus was surveyed in 12,000 sockeye salmon Oncorhynchus nerka from 35 populations in the Skeena and Nass River drainages in British Columbia and 20 populations from Southeast Alaska. Genetic differentiation among populations was observed, with an overall FST of the microsatellite loci of 0.104. Evaluation of the utility of the microsatellite loci for stock identification applications indicated that the accuracy and precision of the estimated stock compositions generally increased as the number of observed alleles at the loci increased. Analysis of simulated mixtures of sockeye salmon from the Nass River, Skeena River, and Southeast Alaska indicated that DNA variation provides a practical way to estimate stock composition, yielding population and regional estimates within 1–3% of the actual values. The validity of the results from the simulated mixtures was evaluated with an analysis of a sample of known origin. Estimated stock compositions on a regional basis (derived from application of a 203-population baseline) were within 1% of the actual contributions, and for the Southeast Alaska component the individual population estimates were generally within 0.5% of the actual contributions. Analysis of fishery samples from a fishery near Tree Point in Southeast Alaska indicated that the major contributors to the fishery in 2001 were sockeye salmon of Nass River, Skeena River, and Southeast Alaska origin, with some components from the Stikine River. Analysis of fishery samples from a fishery near the entrance to Portland Inlet in northern British Columbia indicated that sockeye salmon of Nass River origin dominated the fishery in 2002. Thus, DNA variation provides an effective method for sockeye salmon stock identification.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».