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Enregistrement W2153510570 · doi:10.1093/biostatistics/kxq048

Feature selection in finite mixture of sparse normal linear models in high-dimensional feature space

2010· article· en· W2153510570 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiostatistics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Inference
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFeature selectionCurse of dimensionalityComputer scienceBayesian information criterionMaximizationFeature vectorFeature (linguistics)Boosting (machine learning)Bayesian probabilityData miningMachine learningAlgorithmArtificial intelligenceMathematical optimizationMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rapid advancement in modern technology has allowed scientists to collect data of unprecedented size and complexity. This is particularly the case in genomics applications. One type of statistical problem in such applications is concerned with modeling an output variable as a function of a small subset of a large number of features based on relatively small sample sizes, which may even be coming from multiple subpopulations. As such, selecting the correct predictive features (variables) for each subpopulation is the key. To address this issue, we consider the problem of feature selection in finite mixture of sparse normal linear (FMSL) models in large feature spaces. We propose a 2-stage procedure to overcome computational difficulties and large false discovery rates caused by the large model space. First, to deal with the curse of dimensionality, a likelihood-based boosting is designed to effectively reduce the number of candidate features. This is the key thrust of our new method. The greatly reduced set of features is then subjected to a sparsity inducing procedure via a penalized likelihood method. A novel scheme is also proposed for the difficult problem of finding good starting points for the expectation-maximization estimation of mixture parameters. We use an extended Bayesian information criterion to determine the final FMSL model. Simulation results indicate that the procedure is successful in selecting the significant features without including a large number of insignificant ones. A real data example on gene transcription regulation is also presented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,335
Score d'incertitude au seuil0,797

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle