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Enregistrement W2153641636 · doi:10.5539/jas.v4n3p227

SRAP Markers and Morphological Traits Could Be Used in Test of Distinctiveness, Uniformity, and Stability (DUS) of Lettuce (Lactuca sativa) Varieties

2011· article· en· W2153641636 sur OpenAlexvenueno aff
Lijuan Liu, Zaochang Liu, Hairong Chen, Liguo Zhou, Yunhua Liu, Lijun Luo

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvances in Cucurbitaceae Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversità di Bologna
Mots-clésLactucaGermplasmBiologyTraitIdentification (biology)UPGMAGenetic diversityQuantitative trait locusOptimal distinctiveness theoryMolecular markerHorticultureBiotechnologyBotanyGenetic variationGeneticsComputer sciencePopulationMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The test of distinctiveness, uniformity, and stability (DUS) is a necessary step for variety identification and new variety application. The objective of this study is to provide molecular marker-assisted approach combined with morphological trait-based testing for more convenient and fast DUS test and identification of varieties. Eighteen pairs of SRAP markers and 40 morphological traits for DUS test were applied for genetic diversity analysis of 50 lettuce (Lactuca sativa) varieties. Average polymorphism information content (PIC) of the SRAP markers was 0.80, ranging from 0.39 to 0.97. Cluster analysis using UPGMA of the band patterns amplified by SRAP marker and morphological trait-based clustering separated the varieties into three groups. The correlation coefficient of SRAP marker and morphological traits was 0.5455 reflecting that the two clustering results shared some similarity and consistence. It revealed that the combination of both SRAP marker and morphological trait analysis is more conducive to proper identification and classification of plant varieties, which will undoubtedly bring an alternative choice to DUS testing of plant new varieties and conservation of plant germplasm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,497
Score d'incertitude au seuil0,605

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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