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Enregistrement W2153645244 · doi:10.1165/rcmb.2012-0447oc

Transcription Factor p63 Regulates Key Genes and Wound Repair in Human Airway Epithelial Basal Cells

2013· article· en· W2153645244 sur OpenAlexaff
Stephanie Warner, Tillie‐Louise Hackett, Furquan Shaheen, Teal S. Hallstrand, Anthony Kicic, Stephen M. Stick, Darryl A. Knight

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésRespiratory epitheliumBiologyWound healingSmall interfering RNAEpitheliumGene knockdownCell biologyTranscription factorCancer researchMolecular biologyImmunologyCell cultureGeneRNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The airway epithelium in asthma displays altered repair and incomplete barrier formation. Basal cells are the progenitor cells of the airway epithelium, and can repopulate other cell types after injury. We previously reported increased numbers of basal cells expressing the transcription factor p63 in the airway epithelium of patients with asthma. Here we sought to determine the molecular consequences of p63 expression in basal human airway epithelial cells during wound repair. Because at least six isoforms of p63 exist (N-terminally truncated [ΔN] versus transcriptional activation promoter variants and α, β, or γ 3' splice variants), the expression of all isoforms was investigated in primary human airway epithelial cells (pHAECs). We modulated p63 expression, using small interfering RNA (siRNA) and adenoviral constructs to determine the effects of p63 on 21 candidate target genes by RT-PCR, and on repair using a scratch wound assay. We found that basal pHAECs from asthmatic and nonasthmatic donors predominantly expressed the N-terminally truncated p63α variant (ΔNp63α) isoform, with no disease-specific differences in expression. The knockdown of ΔNp63, using specific siRNA, decreased the expression of 11 out of 21 genes associated with epithelial repair and differentiation, including β-catenin, epidermal growth factor receptor, and Jagged1. The loss of ΔNp63 significantly inhibited wound closure (which was associated with the decreased expression of β-catenin and Jagged1), reduced epithelial proliferation as measured by Ki-67 staining, and increased E-cadherin expression, potentially preventing cytokinesis. In conclusion, ΔNp63α is the major isoform expressed in basal pHAECs, and is essential for epithelial wound repair. The role of ΔNp63α in epithelial barrier integrity requires further study to understand its role in health and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,745

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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