Raeppli: a whole-tissue labeling tool for live imaging of <i>Drosophila</i> development
Notice bibliographique
Résumé
Observation of how cells divide, grow, migrate and form different parts of a developing organism is crucial for understanding developmental programs. Here, we describe a multicolor imaging tool named Raeppli (after the colorful confetti used at the carnival in Basel). Raeppli allows whole-tissue labeling such that the descendants of the majority of cells in a single organ are labeled and can be followed simultaneously relative to one another. We tested the use of Raeppli in the Drosophila melanogaster wing imaginal disc. Induction of Raeppli during larval stages irreversibly labels >90% of the cells with one of four spectrally separable, bright fluorescent proteins with low bias of selection. To understand the global growth characteristics of imaginal discs better, we induced Raeppli at various stages of development, imaged multiple fixed discs at the end of their larval development and estimated the size of their pouch primordium at those developmental stages. We also imaged the same wing disc through the larval cuticle at different stages of its development; the clones marked by Raeppli provide landmarks that can be correlated between multiple time points. Finally, we used Raeppli for continuous live imaging of prepupal eversion of the wing disc.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».