<b> <i>Skp2</i> </b> Gene Copy Number Aberrations Are Common in Non-Small Cell Lung Carcinoma, and Its Overexpression in Tumors with <b> <i>ras</i> </b> Mutation Is a Poor Prognostic Marker
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Skp2 plays a critical role in cell cycle progression, especially at the G(1)-S transition, putatively through its control of several cell cycle regulator proteins. The Skp2 gene is located on a region of chromosome 5p that is commonly overrepresented in lung cancer. The present study aimed to evaluate Skp2 abnormalities and their prognostic value in non-small cell lung cancer (NSCLC). EXPERIMENTAL DESIGN: In total 16 NSCLC cell lines and 163 primary tumors were included in studies to measure Skp2 relative gene copy number, mRNA abundance, and protein level. The tumors were also evaluated for p27 protein expression level and ras mutation. These values were correlated with the clinical and pathological features of the patients. RESULTS: Skp2 relative gene copy number aberrations were found in 88 and 65% of NSCLC cell lines and primary tumors, respectively. Overrepresentation was especially common among squamous cell carcinoma (74%). Both gene copy overrepresentation (13%) and loss (35%) were found in adenocarcinoma. Skp2 relative gene copy number was significantly correlated with mRNA and protein levels, but none of these were correlated with p27 protein levels. Neither high Skp2 protein expression nor ras mutation was prognostically significant. In NSCLCs with ras mutation, however, high Skp2 protein expression was a significant independent poor prognostic marker. CONCLUSION: There appears to be a synergistic interaction between high Skp2 protein expression and ras mutation with negative impact on the survival of NSCLC patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».