Induction of wheat defense and stress-related genes in response to<i>Fusarium graminearum</i>
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium head blight (FHB), caused by species of the fungus Fusarium, is a worldwide disease of wheat (Triticum aestivum L.). The Chinese T. aestivum 'Ning7840' is one of few wheat cultivars with resistance to FHB. To identify differentially expressed genes corresponding to FHB resistance, a cDNA library was constructed using pooled mRNA isolated from glumes of 'Ning7840' harvested at 2, 6, 12, 24, 36, 72, and 96 h after inoculation (hai) with a conidia spore suspension of Fusarium graminearum. Suppressive subtractive hybridization (SSH) cDNA subtraction was carried out using pooled glume mRNAs from the tester and the control. The cDNA library was differentially screened using the forward subtracted cDNAs and the reverse subtracted cDNAs as probes. Twenty-four clones with significant matches to either plant (16 sequences) or fungal (8 sequences) genes were isolated based on their specific hybridization with forward subtracted cDNA and not reverse subtracted cDNA. Six putative defense-related genes were confirmed by real-time quantitative reverse-transcriptase PCR. Many-fold higher induction of three clones (A3F8, B10H1, and B11H3) in the resistant genotypes compared with susceptible genotypes indicates a putative role in the resistance response to Fusarium graminearum. Transcript accumulations of P450, chitinase (Chi1), and one unknown gene (clone B8Q9) in both resistant and susceptible genotypes suggest an involvement in a generalized resistance response to F. graminearum. Nucleotide sequence analysis showed that cDNA clone A4C6 encodes a cytochrome P450 gene (CYP709C3v2), including 14 N-terminal amino acids that have a membrane-associated helical motif. Other domains characteristic of eukaryotic P450 are also present in CYP709C3v2. The deduced polypeptide of cDNA clone B2H2 encodes an acidic isoform of class I chitinase containing a 960-bp coding region. Southern hybridization using aneuploid lines of T. aestivum 'Chinese Spring' indicated that CYP709C3v2 was located on the short arm of chromosomes 2B and 2D.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».