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Enregistrement W2153787694 · doi:10.1128/jb.182.21.6055-6065.2000

Defects in <scp>d</scp> -Alanyl-Lipoteichoic Acid Synthesis in <i>Streptococcus mutans</i> Results in Acid Sensitivity

2000· article· en· W2153787694 sur OpenAlexafffund
David A. Boyd, Dennis G. Cvitkovitch, Arnold S. Bleiweis, Michael Y. Kiriukhin, Dmitri Debabov, Francis C. Neuhaus, Ian R. Hamilton

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchMedical Research CouncilNational Institute of General Medical SciencesMedical Research Council CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésLipoteichoic acidBiologyStreptococcus mutansMutantBiochemistryTransposon mutagenesisMutagenesisOperonPlasmidWild typeMicrobiologyEscherichia coliMolecular biologyTransposable elementBacteriaGeneStaphylococcus aureusGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the cariogenic organism, Streptococcus mutans, low pH induces an acid tolerance response (ATR). To identify acid-regulated proteins comprising the ATR, transposon mutagenesis with the thermosensitive plasmid pGh9:ISS1 was used to produce clones that were able to grow at neutral pH, but not in medium at pH 5.0. Sequence analysis of one mutant (IS1A) indicated that transposition had created a 6.3-kb deletion, one end of which was in dltB of the dlt operon encoding four proteins (DltA-DltD) involved in the synthesis of D-alanyl-lipoteichoic acid. Inactivation of the dltC gene, encoding the D-alanyl carrier protein (Dcp), resulted in the generation of the acid-sensitive mutant, BH97LC. Compared to the wild-type strain, LT11, the mutant exhibited a threefold-longer doubling time and a 33% lower growth yield. In addition, it was unable to initiate growth below pH 6.5 and unadapted cells were unable to survive a 3-h exposure in medium buffered at pH 3.5, while a pH of 3.0 was required to kill the wild type in the same time period. Also, induction of the ATR in BH97LC, as measured by the number of survivors at a pH killing unadapted cells, was 3 to 4 orders of magnitude lower than that exhibited by the wild type. While the LTA of both strains contained a similar average number of glycerolphosphate residues, permeabilized cells of BH97LC did not incorporate D-[(14)C]alanine into this amphiphile. This defect was correlated with the deficiency of Dcp. Chemical analysis of the LTA purified from the mutant confirmed the absence of D-alanine-esters. Electron micrographs showed that BH97LC is characterized by unequal polar caps and is devoid of a fibrous extracellular matrix present on the surface of the wild-type cells. Proton permeability assays revealed that the mutant was more permeable to protons than the wild type. This observation suggests a mechanism for the loss of the characteristic acid tolerance response in S. mutans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,902
Score d'incertitude au seuil0,351

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations118
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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