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Enregistrement W2153873563 · doi:10.1093/pcp/pcn159

Arabidopsis Transient Expression Analysis Reveals that Activation of GLABRA2 May Require Concurrent Binding of GLABRA1 and GLABRA3 to the Promoter of GLABRA2

2008· article· en· W2153873563 sur OpenAlexafffund
Shucai Wang, Jin‐Gui Chen

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Missouri
Mots-clésTranscription factorBiologyActivator (genetics)Transcription (linguistics)ArabidopsisCell biologyMYBPromoterDNA-binding proteinRegulation of gene expressionGeneral transcription factorGeneticsGeneGene expressionMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transcription factors regulate gene expression by directly binding the cis-acting regulatory elements of target genes via their DNA-binding domains or by interacting with other transcription factors. Trichome cell fate determination in Arabidopsis utilizes a lateral inhibition mechanism that relies on the interplay of transcription factors. GLABRA1 (GL1), an R2R3 MYB transcription factor, GLABRA3 (GL3), a basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor, and TRANSPARENT TESTA GLABRA1 (TTG1), a WD40 protein, are believed to form a transcriptional activator complex to control the transcription of GLABRA2 (GL2), which in turn induces trichome formation in shoots. However, the molecular mechanism of the regulation of GL2 expression by this activator complex is still poorly understood. Here we report that GL1 and GL3 control GL2 expression by a previously unrecognized mechanism in which in addition to the protein-protein interaction between GL1 and GL3, concurrent binding of GL1 and GL3 to the promoter of GL2 via their own DNA-binding domains is probably required to activate GL2. We demonstrate that disruption or deletion of the DNA-binding domains in either GL1 or GL3 completely abolishes the transcriptional activity of the GL1-GL3 complex in activating GL2. These results provide new insight into the interplay of GL1 and GL3 transcription factors in the activation of GL2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,303
Score d'incertitude au seuil0,208

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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